Blast Output Refinement Tool

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Das Blast Output Refinement Tool (Bort) ist ein in Perl geschriebenes Skript zur Auswertung von BLAST-Annotationen eines DNA-Sequenzierungsprojektes und kann zum Durchsuchen langer Annotationslisten und zur Quantifizierung von Genexpressionsdaten verwendet werden. Bort wurde 2010 von Benjamin Rieger in Zusammenarbeit mit Hanno Schmidt an der Johannes Gutenberg-Universität Mainz entwickelt und erfreut sich dank permanenter Weiterentwicklung wachsender Beliebtheit in der Next-Generation-Sequencing-Gemeinde.[1]

Einzelnachweise[Bearbeiten]

  1. [1], Krost et al. 2012. The transcriptomes of columnar and standard type apple trees (Malus x domestica) — A comparative study. Gene 498. 223-230.
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